Verfügbarkeit: Strukturbiologische und mechanistische Untersuchungen zur Erkennung und Reparatur von DNA-Photoschäden

Strukturbiologische und mechanistische Untersuchungen zur Erkennung und Reparatur von DNA-Photoschäden:

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Beteilige Person:	Glas, Andreas 1981- (VerfasserIn)
Format:	Hochschulschrift/Dissertation Buch
Sprache:	Deutsch
Veröffentlicht:	Göttingen Cuvillier 2010
Ausgabe:	1. Aufl.
Schlagwörter:	DNS-Reparatur Deoxyribodipyrimidin-Photolyase Ultraviolett DNS-Schädigung (6-4)DNA-Photolyase Kristallstrukturanalyse Hochschulschrift
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adam_text	INHALTSVERZEICHNIS I ZUSAMMENFASSUNG .. ..................* ....... 1 II. SUINMARY .............*.............* ..*...........*.......*.... 4 1. EINLEITUNG 7 1.1 DNA UND DNA-SCHAEDEN 7 1.2 DNA-REPARATURSYSTEME 9 1.3 DNA-PHOTOSCHAEDEN 10 1.3.1 CYCLOBUTANPYRIMIDINDIMER (CPD-PHOTOSCHDEN) 12 1.3.2 (6-4)-PHOTOSCHAEDEN 13 1.3.3 DCWAR VALENZ-ISOMERE 15 1.3.4 MUTAGENITAET VON DNA-PHOTOSCHAEDEN 17 1.4 REPARATUR VON DNA-PHOTOSCHAEDEN 19 1.4.1 EINTEILUNG DER PHOTOLYASEN UND CRYPTOCHROME 19 1.4.2 CPD-PHOTOLYASE 21 1.4.2.1 STRUKTURELLE EINBLICKE IN DIE CPD-PHOTOLYASE 22 1.4.2.2 REPARATURMECHANISMUS DER CPD-PHOTOLYASE 24 1.4.2 (6-4)-PHOTOLYASE 25 2. AUFGABENSTELLUNG ................................................................................................ 31 3. ERGEBNISSE UND DISKUSSION 32 3.1 METHODEN ZUR HERSTELLUNG DES (6-4)-SCHADENS 32 3.1.1 DIREKTE BELICHTUNG VON OLIGONUKLCOTIDCN MIT UV-LICHT 33 3.1.2 HERSTELLUNG DES (6-4)-SCHADENS AUF DINUKLCOTIDEBCNC 39 3.2 HERSTELLUNG UND CHARAKTERISIERUNG DES (TA)-PHOTOSCHADENS 42 3.3 UMWANDLUNG DER (6-4)-PHOTOPRODUKTE IN IHRE ENTSPRECHENDEN DCWAR VALENZ-ISOMERE 46 BIBLIOGRAFISCHE INFORMATIONEN HTTP://D-NB.INFO/1006608478 DIGITALISIERT DURCH INHALTSVERZEICHNIS 3.3.1 UNTERSUCHUNGEN ZUR UMWANDLUNG DURCH BELICHTUNG VON OLIGONUKLEOTIDEN 46 3.3.2 UNTERSUCHUNGEN ZUM MECHANISMUS DER DEWAR-SCHADENSBILDUNG 50 3.4 CHARAKTERISIERUNG DER (6-4)- UND DER (DEW)-PHOTOSCHAEDEN 53 3.4.1 ABSORPTIONSEIGENSCHAFTEN 53 3.4.2 HPLC-MS UND HPLC-MS/MS ANALYSE DER ENZYMATISCH ABGEBAUTEN OLIGONUKLEOTIDE 54 3.5 REPARATURSTUDIEN DER (6-4)- UND DER (DEW)-SCHAEDEN 60 3.5.1 BESTIMMUNG DES PH-OPTIMUMS 61 3.5.2 BESTIMMUNG DER OPTIMALEN BELICHTUNGSZEIT SOWIE DER ENZYMMENGE.. 62 3.5.3 AKTIVITAETSSTUDIEN DER (6-4)-PHOTOLYASE MIT (6-4)-SCHAEDEN 63 3.5.4 AKTIVITAETSSTUDIEN DER (6-4)-PHOTOLYASE MIT DEWAR-SCHAEDEN ALS SUBSTRAT 66 3.6 CHARAKTERISIERUNG DER (6-4)-PHOTOLYASE 73 3.6.1 HOMOLOGIEVERGLEICH DER PHOTOLYASE/CRYPTOCHROM SUPERFAMILIE 73 3.6.2 SPEKTROSKOPISCHE EIGENSCHAFTEN DER (6-4)-PHOTOLYASE 77 3.6.3 IDENTIFIZIERUNG DES ZWEITEN COFAKTORS DER (6-4)-PHOTOLYASE 80 3.6.4 VERGLEICH DER REPARATURAKTIVITAET DER (6-4)-PHOTOLYASE MIT UND OHNE DEM ZWEITEN COFAKTOR F O 82 3.6.5 DIREKTE ISOLIERUNG VON FO AUS D. MELANOGASTER 85 3.7 STRUKTURBIOLOGISCHE UND MECHANISTISCHE UNTERSUCHUNGEN DER (6^)-PHOTOLYASE 87 3.7.1 CO-KRISTALLISATION DES T(6-4)-T-SCHADENS IM KOMPLEX MIT DER (6-4)-PHOTOLYASE AUS D. MELANOGASTER 87 3.7.2 DIFFRAKTIONSANALYSE DER (6-4)-PHOTOLYASE 88 3.7.3 STRUKTURANALYSE DER (6-4)-PHOTOLYASE 89 3.7. INHALTSVERZEICHNIS 3.9 SYNTHESE EINES (6-4)-REPARATURINTERMEDIAT-ANALOGON 114 3.9.1 SYNTHESE DES NUKLEOSIDS A 116 3.9.1.1 SILYL-SCHUETZUNG DES 5 - UND 3 -ENDES VON 2 -DCSOXYURIDIN.... 116 3.9.1.2 STANNYLIERUNG DER C6-POSITION DES GESCHUETZTEN 2 -DESOXYURIDINS 52 116 3.9.2 SYNTHESE DES NUKLEOSIDS B 117 3.9.2.1 TOLUOYL-SCHUETZUNG DES 5 - UND 3 -ENDES VON 2 -DESOXYURIDIN 117 3.9.2.2 CHLORIERUNG DER C4-POSITION DES GESCHUETZTEN 2 -DESOXYURIDINS 54 118 3.9.3 KUPPLUNG UND FUNKTIONALISIERUNG DER BEIDEN NUKLEOSIDE A UND B ZUM ANALOGON 62 118 3.9.3.1 5W//E-KREUZKUPPLUNG DER BEIDEN BUILDING BLOCKS 118 3.9.3.2 ENTSCHUETZUNG DER *SILYLKLAMMER DES DINUKLEOSIDS 56 119 3.9.3.3 SCHUETZUNG DER 5 -OH-GRUPPE DES PYRIMIDINRINGS VON 57 MIT DMT-CL 120 3.9.3.4 SCHUETZUNG DER 3 -OH-GRUPPE DES PYRIMIDINRINGS VON 58 MIT TBDMS-CL 121 3.9.3.5 ENTSCHUETZUNG DER TOLUOYLSCHUTZGRUPPEN DES DINUKLEOSIDS 59 121 3.9.3.6 SELEKTIVE SCHUETZUNG DER 5 -OH-GRUPPC DES PYRIMIDONRINGS VON 60 MIT TBDPS-CL 122 3.9.3.7 DARSTELLUNG DES PHOSPHORAMIDITS 62 122 3.9.4 EINBAU UND CHARAKTERISIERUNG VON 51 IN DNA 123 3.9.5 BIOCHEMISCHE UND STRUKTURBIOLOGISCHE UNTERSUCHUNGEN MIT DEM REPARATURANALOGON UND DER (6-4)-PHOTOLYASE 125 3.10 ZUSAMMENFASSUNG UND AUSBLICK 126 7. ANHANG 179 INHALTSVERZEICHNIS 4. EXPERIMENTELLER TEIL 134 4.1 MATERIAL UND METHODEN 134 4.2 SYNTHESEVORSCHRIFTEN UND ANALYTISCHE DATEN 143 4.2.1 SYNTHESE DES (6-4)-REPARATUR-ANALOGON 143 4.2.2 SYNTHESE DES DESAZAFLAVINS F O 157 4.2.3 SYNTHESE DES FORMACETALVERBRUECKTEN T(6-4)T-DINUKLEOTIDS 161 5. ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 162 6. LITERATURVERZEICHNIS 166
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