Verfügbarkeit: Molekulare Systematik und Biogeographie der Gattung Lepidium L. und verwandter Sippen (Brassicaceae)

Molekulare Systematik und Biogeographie der Gattung Lepidium L. und verwandter Sippen (Brassicaceae):

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Beteilige Person:	Brüggemann, Holger (VerfasserIn)
Format:	Hochschulschrift/Dissertation Buch
Sprache:	Deutsch
Veröffentlicht:	2000
Schlagwörter:	Hochschulschrift Kresse Sequenzanalyse > Chemie Biogeografie Phylogenetik
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adam_text	DISSERTATION ZUR ERLANGUNG DES DOKTORGRADES DER NATURWISSENSCHAFTEN IM FACHBEREICH BIOLOGIE/CHEMIE DER UNIVERSITAET OSNABRUECK MOLEKULARE SYSTEMATIK UND BIOGEOGRAPHIE DER GATTUNG LEPIDIUML. UND VERWANDTER SIPPEN (BRASSICACEAE) VON HOLGER BRUEGGEMANN * OSNABRUECK 2000 INHALTSVERZEICHNIS INHALTSVERZEICHNIS ABKUERZUNGSVERZEICHNIS 1. EINLEITUNG 1 2. MATERIAL UND METHODEN 9 2.1. PFLANZENMATERIAL 9 2.2. CHLOROPLASTEN-DNA-SEQUENZANALYSEN 15 2.2.1. GESAMT-DNA ISOLATION NACH DOYLE & DOYLE (1987), VERAENDERT 16 2.2.2. PCR-AMPLIFIKATION DER CHLOROPLASTEN-DNA BEREICHE 16 2.2.3. KONTROLLE UND AUFIREINIGUNG DER PCR-AMPLIFIKATE 17 2.2.4. DIREKTSEQUENZIERUNG DER AMPLIFIKATIONSPRODUKTE 17 2.2.5. ELEKTROPHORETISCHE AUFTRENNUNG DER KETTENABBRUCH-FRAGMENTE 18 UND TRANSFER AUF EINE NYLONMEMBRAN 2.2.6. DETEKTION DER DNA-FRAGMENTE 18 2.3. AUSWERTUNG DER DNA-NUKLEOTIDSEQUENZEN 19 2.3.1. ERSTELLUNG DER DATENSAETZE UND ALIGNMENT 19 2.3.2. GI-STATISTIK (HUELSENBECK 1991; HILLIS & HUELSENBECK 1992) 20 2.3.3. PARSIMONIEANALYSEN 20 2.3.3.1. KONSISTENZINDEX (KLUGE & FARRIS 1969) 22 2.3.3.2. BOOTSTRAP-ANALYSEN (FELSENSTEIN 1985) 22 2.3.4. ERMITTLUNG VON SEQUENZDIVERGENZEN 23 2.4. NICHTMOLEKULARE DATEN 23 3. ERGEBNISSE 24 3.1. AMPLIFIKATION UND SEQUENZIERUNG 24 3.2. DATENSATZ UND ALIGNMENT 25 3.3. GI-STATISTIK 29 3.4. FITCH-PARSIMONIEANALYSEN 29 3.5. KONSISTENZINDEX UND BOOTSTRAPANALYSEN 33 3.6. PHYLOGENETISCHE ANALYSE 34 INHALTSVERZEICHNIS 4. 4.1. 4.2. 4.2.1. 4.2.2. 4.2.2.1. 4,3. 4.4. 4.4.1. 4.4.2. 4.4.3. 4.4.4. 4.5. 4.5.1. 4.5.2. 4.5.2.1. 4.5.2.2. 4.5.2.3. 4.5.2.4. 4.5.3. 4.5.3.1. 4.5.3.2. 4.5.3.3. 4.5.3.4. 4.5.3.5. 4.6. 4.7. 4.7.1. 4.7.2. 4.7.3. 4.7.4. 4.7.5. 4.8. DISKUSSION KRITISCHE BEWERTUNG DER VERWENDETEN MOLEKULAREN MARKER INKONGRUENZ ZWISCHEN GENOMPHYLOGENIEN KONVERGENTE UND/ODER SCHNELLE MORPHOLOGISCHE EVOLUTION HYBRIDISIERUNG UND INTROGRESSION CONCERTED EVOLUTION DER ITS-REPEATS VERGLEICH DER CP-DNA-PHYLOGENIE MIT DER ITS-PHYLOGENIE: GEMEINSAMKEITEN UND UNTERSCHIEDE HISTORISCHER RUECKBLICK AUF DIE SYSTEMATIK DER UNTERSUCHTEN GATTUNGEN LEPIDIUM L. CORONOPUS ZINN. CARDARIA DESV. STROGANOWIA KAR. ET KLR., WINKLERA REGEL, ANDRZEIOWSKIA REICHENB. PHYLOGENETISCHE ANALYSE DER MOLEKULAREN STAMMBAEUME MONOPLOCA S. STR. (KLADE I) LEPIA S.L. (KLADE II) LEPIA S.STR. CARDARIA LEPIDIUM PERFOLIATUM IST CARDARIA DRABA (L.) DESV. EIN HYBRID ? LEPIDIUM S.STR. (KLADE III) DIE KLEINEN SEKTIONEN CARDAMON UND LEPIOCARDAMON DIE ARTEN AUS AUSTRALIEN UND NEUSEELAND DIE TAXA DER PAZIFISCHEN INSELN CORONOPUS DIE GATTUNGEN ANDRZEIOWSKIA, STROGANOWIA UND WINKLERA BLUETENREDUKTIONSMUSTER AUSBREITUNGSGESCHICHTE SUEDAFRIKA NORDAMERIKA SUEDAMERIKA AUSTRALIEN / NEUSEELAND PAZIFISCHER RAUM LEPIDIUM ALS KULTURPFLANZE 41 41 46 47 47 48 50 50 51 54 55 56 57 57 60 60 62 64 65 66 68 70 72 73 76 78 82 86 86 88 89 91 92 INHALTSVERZEICHNIS 5. ZUSAMMENFASSUNG 95 6. LITERATURVERZEICHNIS 97 7. ANHANG 111 7.1. VERWENDETE PUFFER, LOESUNGEN UND PRIMER, NACH KAPITELN GEORDNET 111 7.1.1. GESAMT-DNA-ISOLIERUNG NACH DOYLE & DOYLE (1987), VERAENDERT 111 7.1.2. PCR-AMPLIFIZIERUNG DER NICHT KODIERENDEN CPDNA BEREICHE 111 7.1.3. KONTROLLE UND AUFREINIGUNG DER PCR-AMPLIFIKATE 111 7.1.4. DIREKTSEQUENZIERUNG DER AMPLIFIKATIONSPRODUKTE 111 7.1.5. ELEKTROPHORETISCHE AUFTRENNUNG DER KETTENABBRUCH-FRAGMENTE 112 UND TRANSFER AUF EINE NYLONMEMBRAN 7.1.6. DETEKTION DER DNA-FRAGMENTE 112 7.2. CHEMIEKALIEN UND VERBRAUCHSMATERIALEN 112 7.3. ARBEITSGERAETE 113 7.4. CP-DNA DATENMATRIZES: SEQUENZALIGNMENT UND O/1-GAPMATRIX 114 ZWEI BEIBLAETTER
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