Java für die Life Sciences: eine Einführung in die angewandte Bioinformatik
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| Format: | Buch |
| Sprache: | Deutsch |
| Veröffentlicht: |
Heidelberg
O'Reilly
2021
|
| Ausgabe: | 1. Auflage |
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| Umfang: | XVI, 250 Seiten Illustrationen, Diagramme 24 cm x 16.5 cm |
| ISBN: | 9783960091257 3960091257 |
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| adam_text | INHALT
EINLEITUNG
.......................................................................................
IX
1
EINFUEHRUNG
IN
DIE
ARBEIT
MIT
JAVA
.....................................................
1
DIE
UMGEBUNG
EINRICHTEN
.........................................................................
1
JDK
INSTALLIEREN
....................................................................................
1
JAVA
IN
DER
KOMMANDOZEILE
...............................................................
3
EINE
IDE
EINRICHTEN:
ECLIPSE
...............................................................
4
DIE
ERSTE
JAVA-AN
WENDUNG
.......................................................................
7
VERSIONSVERWALTUNG
GIT
.............................................................................
10
MAVEN
........................................................................................................
12
ABHAENGIGKEITEN
DEFINIEREN
.................................................................
13
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
14
2
JAVA
ZUM
AUFFRISCHEN
....................................................................
17
AUFBAU
EINES
JAVA-PROGRAMMS
...................................................................
17
VARIABLEN
..............................................................................................
20
VERGLEICHE
............................................................................................
26
ARRAYS
..................................................................................................
26
SCHLEIFEN
..............................................................................................
TI
ERWEITERUNGEN
HINZUFUEGEN
................................................................
30
EXCEPTIONS
..........................................................................................
32
EXTERNE
BIBLIOTHEKEN
HINZUFUEGEN
............................................................
34
JAR-FILES
HINZUFUEGEN
.........................................................................
35
LIBRARIES
BAUEN
...................................................................................
35
GRUNDLAGEN
DER
DATENVERARBEITUNG
..........................................................
36
DATENARCHITEKTUR
UND
DATENMODELLIERUNG
........................................
36
DIE
VERWENDUNG
VON
LISTEN
UND
ANDEREN
DATENSTRUKTUREN
............
42
DER
UMGANG
MIT
PARAMETERN
............................................................
48
DAS
LESEN
UND
SCHREIBEN
VON
DATEIEN
UND
DATEN
...........................
53
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
61
I
V
3
DATA
ENGINEERING
MIT
JAVA
..............................................................
63
GRUNDLAGEN
................................................................................................
63
DATEN,
INFORMATIONEN,
WISSEN
UND
WEISHEIT
.................................
64
DER
DATA
LIFECYCLE
..............................................................................
67
KNOWLEDGE
REPRESENTATION
UND
DAS
ARBEITEN
MIT
EXTERNEN
DATENQUELLEN
70
XML
.....................................................................................................
71
JSON
...................................................................................................
11
RDF
UND
SEMANTIC
WEB
...................................................................
79
VERARBEITEN
UND
PARSEN
VON
(UN-)
FORMATIERTEM
TEXT
.......................
80
ARBEITEN
MIT
DATENBANKEN
.......................................................................
86
RELATIONALE
DATENBANKEN
...................................................................
88
SQL
MIT
JAVA
......................................................................................
96
NICHT
RELATIONALE
DATENBANKEN
.........................................................
102
ARBEITEN
MIT
RESTFUL-APIS
.......................................................................
104
ANALYSEPIPELINES
MIT
BASH-SKRIPTEN
BAUEN
............................................
108
PARALLEL
ENVIRONMENTS
.......................................................................
110
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
111
4
DATA
MINING
...............................................................................
115
KLASSIFIZIERUNG
............................................................................................
116
BINNING
................................................................................................
116
HASHING
..............................................................................................
122
STATISTISCHE
MODELLE
...........................................................................
124
CLUSTERING
...................................................................................................
132
GRAPH-BASIERTES
CLUSTERING
...............................................................
132
K-MEANS
..............................................................................................
134
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
135
5
NETZWERKANALYSE:
GRAPHEN
MIT
JAVA
..................................................
139
JGRAPHT
IN
DER
NETZWERKANALYSE
.............................................................
140
GERICHTETE
GRAPHEN
..................................................................................
144
NAHRUNGSKETTEN
..................................................................................
145
SOZIALE
UND
SPEZIES-SPEZIFISCHE
RELATIONEN
......................................
148
UNGERICHTETE
GRAPHEN
................................................................................
151
PROTEIN-PROTEIN-INTERAKTIONSNETZWERKE
............................................
151
AEHNLICHKEITSGRAPHEN
.........................................................................
154
WEITERE
BEISPIELE........................................................................................
158
SUBSTRUCTURE-
UND
MAXIMAL-COMMON-SUBSTRUCTURE-SUCHE
..........
158
ZUFALLSGRAPHEN
....................................................................................
164
SOZIALE
NETZWERKE
.............................................................................
166
GERICHTETE
PROTEIN-INTERAKTIONSNETZWERKE
........................................
172
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
175
VI
|
INHALT
6
BILDVERARBEITUNG
MIT
JAVA
UND
IMAGEJ
..............................................
177
EINFUEHRUNG
IN
IMAGEJ
.................................................................................
179
LESEN
UND
SCHREIBEN
VON
BILDERN
......................................................
180
IMAGEPROCESSOR
....................................................................................
181
ELEMENTARE
BILDBEARBEITUNG
...............................................................
182
PARTICLE
ANALYSIS
..........................................................................................
187
OBJEKTKLASSIFIZIERUNG
.................................................................................
191
SUPERVISED
CLASSIFICATION
...................................................................
191
UNSUPERVISED
CLASSIFICATION
...............................................................
193
FARBANALYSEN
..............................................................................................
194
PRAXISPROJEKTE
............................................................................................
195
TUMORERKENNUNG
IN
CT-SCANS
DER
LUNGE
........................................
195
PFLANZENMORPHOLOGIE
.........................................................................
203
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
207
7
SEQUENZANALYSE
MIT
BIOJAVA
............................................................
211
GRUNDLAGEN
DER
SEQUENZANALYSE
...............................................................
212
EINFUEHRUNG
IN
BIOJAVA
...............................................................................
216
DATENBANKSUCHE
.................................................................................
218
LESEN
UND
SCHREIBEN
VON
SEQUENZEN
................................................
219
EIGENSCHAFTEN
VON
SEQUENZEN
IN
BIOJAVA
..........................................
224
SEQUENCE
ALIGNMENT
.................................................................................
225
MULTIPLE
SEQUENCE
ALIGNMENT
.............................................................
229
BLAST
..................................................................................................
230
NEXT-GENERATION
SEQUENCING
DATA
ANALYSIS
.....................................
235
UEBUNGSAUFGABEN
........................................................................................
240
INDEX
..............................................................................................
243
INHALT
|
VII
|
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Inhaltsverzeichnis
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Teilbibliothek Mathematik & Informatik
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0102 BIO 110 2021 A 627
Lageplan |
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| Exemplar 1 | Ausleihbar Am Standort |
Teilbibliothek Weihenstephan
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1002 BIO 110 2021 A 138
Lageplan |
|---|---|
| Exemplar 1 | Ausleihbar Am Standort |