Verfügbarkeit: Computerbasierte Analyse von pH-induzierten Effekten auf die Proteinstruktur

Computerbasierte Analyse von pH-induzierten Effekten auf die Proteinstruktur:

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Beteilige Person:	Socher, Eileen (VerfasserIn)
Format:	Hochschulschrift/Dissertation Buch
Sprache:	Deutsch Englisch
Veröffentlicht:	Erlangen ; Nürnberg 2017
Schlagwörter:	Computational chemistry Wasserstoffionenkonzentration Proteine Konformationsänderung Hochschulschrift
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adam_text	INHALTSVERZEICHNIS VORWORT................................................................................................................................................. VII SUMMARY...................................................................................................................................................1 ZUSAMMENFASSUNG....................................................................................................................................3 1 EINLEITUNG.........................................................................................................................................5 1.1 PROTEINE.....................................................................................................................................5 1.1.1 EINFLUSS DES PH-WERTES AUF PROTEINE...................................................................................6 1.1.2 UNTERSUCHTE PROTEINSYSTEME.............................................................................................. 11 1.2 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN VON PROTEINEN......................................................................15 1.3 BERUECKSICHTIGUNG DES PH-WERTES IN MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN..................................19 1.3.1 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN MIT KONSTANTER PROTONIERUNG..........................................19 1.3.2 MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN MIT KONSTANTEM PH-WERT ......................... 20 1.3.3 DIE GRUNDIDEE VON PH-TITRIERENDEN MOLEKUELDYNAMIK-SIMULATIONEN .............................. 22 2 ZIELE DER ARBEIT.............................................................................................................................. 25 3 EIGENE PUBLIKATIONEN......................................................................................................................27 3.1 PUBLIKATION IN SCIENTIFIC REPORTS............................................................................................. 27 3.2 PUBLIKATION IM JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. .................................................................... 47 3.3 PUBLIKATION IM JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B.....................................................................75 4 AUSBLICK........................................................................................................................................101 4.1 ERWEITERUNG DER PHTMD-SIMULATION AUF EIN EXPLIZITES LOESUNGSMITTEL .............................. 101 4.2 BERUECKSICHTIGUNG DER TEMPERATUR BEI SIMULATIONEN MIT VERAENDERLICHER PROTONIERUNG....102 4.3 PARAMETRISIERUNG DER N- UND C-TERMINALEN AMINOSAEUREN ................................................. 102 4.4 VISUALISIERUNG VON AMBER-SIMULATIONEN MIT VERAENDERLICHER PROTONIERUNG.....................104 LITERATURVERZEICHNIS............................................................................................................................. 107 A ANHANG.......................................................................................................................................... 111 A. 1 ABKUERZUNGSVERZEICHNIS..........................................................................................................111 A.2 ABBILDUNGSVERZEICHNIS.......................................................................................................... 112 A.3 TABELLENVERZEICHNIS...............................................................................................................112 A.4 PUBLIKATIONEN UND KONFERENZBEITRAEGE................................................................................... 113 A.5 DANKSAGUNG........................................................................................................................... 117
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