Untersuchungen zur Progression des Harnblasenkarzinoms:
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|---|---|
| adam_text | Inhaltsverzeichnis
1. Einleitung 5
1.1 Das urotheliale Harnblasenkarzinom 6
1.1.1 Oberflächliche Tumoren (Ta, Tis, T1) 6
1.1.2 Invasive Tumoren (pT2 pT4) 8
1.2 Molekulare Prozesse bei der Tumorprogression 10
1.2.1 Zellzyklusregulation und Karzinogenese 11
1.2.2 Bedeutung von „Checkpoints des Zellzyklus 13
1.3 Molekulare Veränderungen und Progression des Harnblasenkarzinoms 14
1.3.1 Chromosomale Veränderungen 14
1.3.2 Onkogene 15
1.3.3 Tumor Suppressor Gene 15
1.3.4 Metastasen Suppressor Gene 18
1.4 Die Transmembran 4 Genfamilie 18
1.5 Fragestellung und Ziele 20
2 Material und Methoden 22
2.1 Patientenkollektive und Gewebeproben 22
2.1.1 Patienten mit fortgeschrittenem Harnblasenkarzinom 22
2.1.2 Patienten mit oberflächlichen Harnblasenkarzinomen 25
2.1.3 Gewebeproben für die Analyse CD9 und p53 26
2.1.4 Gewebeproben für die cDNA Mikroarray Analysen 27
2.2 Untersuchung des Metastasen Suppressor Gens CD9 31
2.2.1 Immunhistochemie 31
2.2.2 RNA Isolierung: 32
2.2.2 RT PCR und Sequenzierung 32
2.2.3 Statistische Auswertung (Klinische Parameter, CD9 Expression, p53 Alterationen) 33
2
2.3 Expressionsanalysen mittels Microarray 35
2.3.1 Atlas™ Human Cancer 1.2 Array 35
2.3.2 Affymetrix GeneChip® 38
2.3.3 Validierung der Expressionsdaten mittels Northern Blot Analyse 40
3 Ergebnisse 42
3.1 Histopathologische Parameter und Progression des Harnblasenkarzinoms 42
3.1.1 Zusammensetzung des Patientenkollektivs mit fortgeschrittenem Blasenkarzinom 42
3.1.2 Rezidivfreie, tumorspezifische und Gesamt Überlebenszeit 44
3.1.3 Lokalisation und Zeitpunkt von Tumorrezidiven 48
3.2 Das Metastasen Suppressor Gen CD9 und Progression des Blasenkarzinoms 49
3.2.1 Expressions und Mutationsanalyse von CD9 49
3.2.2 Korrelation mit dem onkologischen Langzeitbehandlungsergebnis 52
3.3 Expressionsprofil urothelialer Harnblasenkarzinome 56
3.3.1 Atlas™ Human Cancer 1.2 Genexpressionsprofil 57
3.3.2 Validierung mittels Northern Blot Analyse 62
3.3.3 Affymetrix GeneChip® Analysen 66
4. Diskussion 73
4.1 Histopathologische Parameter und Prognose des Harnblasenkarzinoms 74
4.1.1 Kollektiv invasiver Tumoren 74
4.1.2 Überlebenszeitanalysen 76
4.1.3 Lokalisation und Zeitpunkt von Tumorrezidiven 77
4.2 Nutzung einzelner molekularer „Marker als prognostische Faktoren 80
4.2.1 Bedeutung des p53 Tumor Suppressor Gens 81
4.2.2 Expressions und Mutationsanalysen von CD9 82
4.3 Genexpressionsprofil urothelialer Harnblasenkarzinome 87
4.3.1 Auswertung von Mikroarray Expressionsdaten 88
4.3.2 Validierung der Array Daten 94
3
5. Zusammenfassung 100
6. Literaturverzeichnis 103
7. Danksagung 121
4
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